Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms