Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a1P43024 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms