Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a2P43006 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a2P43006 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms