Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept1P42209 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept1P42209 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sept1P42209 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms