Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf9P41274 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf9P41274 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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