Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
VhlP40338 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VhlP40338 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VhlP40338 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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