Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf3rP40223 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf3rP40223 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms