Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf2P39429 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms