Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms