Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtlP38585 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtlP38585 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TtlP38585 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtlP38585 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtlP38585 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtlP38585 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtlP38585 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms