Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk2P38575 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms