Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sar1aP36536 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms