Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms