Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab18P35293 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms