Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp13P33435 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp13P33435 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms