Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp2P29594 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp2P29594 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms