Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms