Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mmp3P28862 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms