Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RxraP28700 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RxraP28700 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RxraP28700 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RxraP28700 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RxraP28700 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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