Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col2a1P28481 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms