Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Hoxd10P28359 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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