Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
U2af2P26369 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms