Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf2P23798 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf2P23798 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms