Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms