Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd8P23463 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms