Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms