Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5bP21271 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms