Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms