Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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