Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P20040 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P20040 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P20040 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P20040 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P20040 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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