Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox5bP19536 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms