Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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