Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RargP18911 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RargP18911 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RargP18911 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RargP18911 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RargP18911 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RargP18911 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RargP18911 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms