Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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