Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms