Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcna1P16388 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcna1P16388 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms