Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms