Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrphP15331 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrphP15331 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrphP15331 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrphP15331 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrphP15331 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrphP15331 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrphP15331 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrphP15331 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms