Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms