Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms