Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn1P12960 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms