Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms