Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtcP11725 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtcP11725 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtcP11725 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtcP11725 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms