Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tnp1P10856 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms