Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms