Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms