Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa9P09631 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms