Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms