Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06321 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06321 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06321 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06321 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06321 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06321 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06321 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms