Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa2P05367 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa2P05367 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Saa2P05367 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa2P05367 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa2P05367 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa2P05367 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms